1. MECANISMOS CELULARES Y GENOTOXICOLOGÍA

MISIÓN:

Evaluar el efecto citotóxico, citostático y genotóxico de nuevos metabolitos presentes en la biodiversidad vegetal y ambiental sobre varios modelos biológicos celulares, tanto in vitro como in vivo mediante el uso de biomarcadores; así como esclarecer los mecanismos bioquímicos por los cuales dichos metabolitos inducen la muerte de las células.

VISIÓN:

Las condiciones ambientales, nutricionales y el incremento a las afecciones a la salud nos obligan a buscar en la biodiversidad ambiental metabolitos con propiedades medicinales que sirvan para mitigar y mejorar la calidad de vida de los seres humanos.

OBJETIVOS:

• Contar con una batería de test que nos permitan evaluar la actividad genotóxica, citotóxica y genotóxica de posibles principios activos provenientes de la flora sobre varios modelos biológicos que sirvan como alternativa de tratamiento y prevención de enfermedades como el cáncer.
• Determinar posibles mecanismos de muerte celular o mecanismos de acción que ejercen los metabolitos secundarios sobre varios modelos biológicos
• A través de herramientas bioestadísticas validar nuestros resultados obtenidos ya sea en modelos “in vivo” o “in vitro”.

Proyectos en ejecución:

Prospección de Principios Activos Anticancerosos de la Flora del Sur del Ecuador
Resumen: El cáncer se ha convertido en un problema de salud mundial, hoy en día para su tratamiento se utiliza los antienoplásicos los cuales actúan directamente sobre el DNA, produciendo daño en células no cancerígenas. Por ello la importancia de buscar sustancias bioactivas mas especificas en microorganismos y plantas; debido que la producción de metabolitos se ve favorecida por el microambiente el Ecuador cuenta con gran ventaja sobre otros paises ya que posee un 20% de especies endémicas y la mayoría sin estudiar. Para llevar a cabo los objetivos del presente proyecto utilizamos biomarcadores que nos permiten evaluar parámetros como tipo de muerte celular, genotoxicidad y citocixidad que pueden ser inducida por los metabolitos en estudio.

A futuro:

Determinación de los mecanismos de acción por los cuales los metabolitos secundarios inducen la muerte sobre líneas celulares y las principales proteínas implicadas, así mismo determinar la fase del ciclo celular en la cual las células se detienen de acuerdo a la acción que puedan ejercer los metabolitos.

INTEGRANTES:
Dra. Natalia Bailón Moscoso  –  E-mail: ncbailon@utpl.edu.ec
Bq. María Isabel Ramírez  –  E-mail: miramirez@utpl.edu.ec
Bq. Luis Miguel Guamán  –  E-mail: lmguaman@utpl.edu.ec

2. DIVERSIDAD MOLECULAR DE PATOLOGIAS HUMANAS

Visión:

Caracterizar genéticamente la población ecuatoriana, para así poder aportar con la generación de nuevos conocimientos en el campo biomédico. Enfocándonos a los problemas de salud que aquejan a nuestra sociedad.

Misión:

Evaluar la diversidad de la población ecuatoriana y la posible de susceptibilidad a desarrollar ciertas enfermedades, esperando contribuir en la prevención y control de las mismas

Objetivos:

• Caracterizar la población ecuatoriana mediante la identificación de genes de susceptibilidad a enfermedades.
• Evaluar la diversidad de la población ecuatoriana mediante la identificación de mutaciones y/o  polimorfismos, y su relación con diferentes enfermedades de interés para la región.
• Explicar el efecto de las mutaciones y/o polimorfismos en la funcionalidad proteíca y su contribución a las enfermedades.

Proyectos en ejecución:

El linfocito como modelo para el estudio de calpaínas en individuos diabéticos y no diabéticos, y Evaluación de genes de susceptibilidad a Diabetes Mellitus Tipo 2 en personas de la etnia Saraguro – Ecuador.

Resumen:La diabetes tipo 2 es una patología de alta incidencia a nivel mundial; aunque en nuestro país no existen estadísticas exactas, se conoce que afecta a una cantidad elevada de individuos adultos. Esta patología se da por una resistencia a la insulina y/o fallo en la secreción de dicha hormona; lo cual lleva a una reducción de la expectativa de vida. Debido a que es de tipo multifactorial, es importante el análisis del factor genético en nuestra población por medio de la identificación de genes que den suceptibilidad o que protejan al desarrollo de la patología en los diferentes grupos étnicos  como son los indígenas (población Saraguro) y mestizos (población de Loja).

A futuro:

Continuar con la evaluación de la suceptibilidad genética de nuestra población de la diabetes tipos 2, así como comenzar a enfocarnos a otros tipos de patologías que afecten al sur del Ecuador.

INTEGRANTES:
Dra. Paula Torres Bailón  –  E-mail: pctorres@utpl.edu.ec
Bq. Ana Paulina Arévalo  –  E-mail: aparevalo@utpl.edu.ec
Bq. Ana Belen Córdova  –  E-mail: abcordovax@utpl.edu.ec

3. ECOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA DE LA CONSERVACIÓN

La ecología molecular y la genética de la conservación son ramas de la ecología y la genética encaminadas a resolver problemas y preguntas ecológicas mediante el uso de herramientas moleculares.

Esta línea de investigación del CBCM aborda temas que pueden aportar en forma decisoria al desarrollo sostenible de nuestra región y país; por un lado estudia la sistemática y funcionalidad de microorganismos simbiontes como las micorrizas, muchas de las cuales interactúan con varios de los cultivos actuales y potenciales de nuestro biodiverso País; por otro lado analiza la diversidad y estructura genética poblacional de especies clave y amenazadas, cuya subsistencia puede ser crucial para la funcionalidad y prevalencia de los ecosistemas naturales remanentes que abastecen de servicios ambientales estratégicos como el agua.
La capacidad instalada del CBCM nos está permitiendo incursionar en temas directamente relacionados con el sector productivo como es el caso de la caracterización molecular del café     y potencialmente otros cultivos emergentes y promisorios de nuestra región y país.

Visión:

En el año 2020 la línea de investigación se encuentra conformada por un equipo activo y sólido de investigadores, estudiantes de pre y postgrado que generan información crucial para responder preguntas de ecología, manejo, uso y conservación de la biodiversidad del Ecuador.

Misión:

Con el apoyo de herramientas moleculares, estudiar la evolución, estructura, composición y funcionalidad de la biodiversidad Ecuatoriana y plantear estrategias para su uso, manejo, monitoreo y conservación.

Objetivos:

1. Ejecutar, con un alto rigor científico y ético, investigaciones de especies neotropicales mediante el uso de herramientas moleculares

2. Procurar que las investigaciones realizadas aporten a la formación científica del capital humano local

3. Publicar y difundir los resultados relevantes de las investigaciones desarrolladas

4. Promover la interdisciplinaridad y cooperación de las investigaciones con otros centros de la Universidad o instituciones externas interesadas

5. Aportar a la consolidación y fortalecimiento de estrategias e iniciativas regionales, nacionales e internacionales relacionadas al estudio, manejo, monitoreo, uso y conservación de la biodiversidad.
En esta línea de investigación encontramos los siguientes grupos de trabajo:

MICORRIZAS

El equipo de investigación en hongos y micorrizas del CBCM mediante el uso combinado de microscopia y biología molecular, se dedica al estudio de la sistemática, diversidad, funcionalidad y ecología de hongos en general con especial énfasis en micorrizas. Además busca aportar con alternativas para la conservación y aprovechamiento sustentable de este grupo de organismos.

El trabajo se realiza valorando a las personas como el elemento más importante del grupo, al conocimiento como un activo que debe ser compartido por todos sus integrantes y al trabajo en equipo y en red como base para la generación y difusión del conocimiento.

Proyectos en ejecución:

VALORAM (Valorización de la diversidad microbiana Andina a través de la intensificación sostenible de los  sistemas de agricultura basados en papa.)

Resumen:VALORAM intenta explorar y aprovechar la diversidad microbiana del suelo andino mediante la identificación y preservación de microorganismos asociados a cultivo de papa, dilucidando el rol de éstos en la promoción del crecimiento y control de patógenos en plantas, desarrollando tecnologías alternativas que permitan mejorar la sustentabilidad y productividad del cultivo en la zona andina.

Micorrizas de Orquídeas

Hongos micorrízicos para el crecimiento y rehabilitación de orquídeas en un bosque tropical: énfasis en tulasnellales, sistemática molecular vs. Morfología.

Resumen: Conocer la diversidad de hongos micorrizicos asociadas a las orquídeas y el efecto del hábitat sobre la comunidad de hongos micorrízicos asociados a orquídeas     epífitas y terrestres.

A futuro:

• Reinforcement of the fungal expertise in Ecuador via case studies of fungal plants interactions in selected ecosystems and the the development of biotechnological-oriented fungal resource centres – Stephane Declerck UCL
• Technology Transfer in South Ecuador: Facilitation of biodiversity in montane ecosystems by large-scale conversion of monocultures into mixed forests – Sven Gunter, Matthias Rillig Freie Universitaet Berlin

INTEGRANTES:

Dr. Juan Pablo Suarez Ch.  –  E-mail: jpsuarez@utpl.edu.ec
Bq. Paulo Herrera Vargas  –  E-mail: piherrera@utpl.edu.ec
Bq. Dario Cruz Sarmiento  –  E-mail: djcruz@utpl.edu.ec
Ing. Hernán Lucero Mosquera  –  E-mail: hplucero@utpl.edu.ec
Bq. Oscar Vivanco Galvan –  E-mail: oavivanco@utpl.edu.ec
Ing. Paul Lojan Armijos  –  E-mail: pdlojan@utpl.edu.ec
Ing. Yuliana Jiménez Gaona – E-mail: ydjimenez@utpl.edu.ec

FLORA

Proyectos ejecutados:

Caracterización isosenzimática del banco de Vasconcelleas (Caricaceae) de la UTPL Loja-Ecuador.

Proyectos en ejecución:

1. Estudio de los procesos de dispersión y colonización de Epidendrum rhopalostele (Orchidaceae) usando marcadores moleculares.

Resumen:Este proyecto propone estudiar los mecanismos de dispersión de la orquídea Epidendrum rhopalostele, y la dinámica de colonización de nuevos forófitos a partir del estudio de la estructura genética espacial en un bosque secundario, que permitirá además conocer la diversidad genética y la distribución de la variación dentro y entre las poblaciones, comprobando si existe fllujo génico o si las poblaciones están aisladas. Los resultados obtenidos permitirán valorar las consecuencias de la fragmentación de hábitat. Todo ello servirá de base para el manejo y conservación in situ de poblaciones de orquídeas epífitas en general, y de E. rhopalostele en particular.

2. Revisión taxonómica y filogenética de los géneros Sticta (Schreb) Ach. y Pseudocyphellaria Vain. D.C. en Ecuador.

Resumen: La flora liquénica en Ecuador ha sido muy poco estudiada hasta el momento (especies, distribución, preferencias ecológicas y relaciones filogenéticas). El objetivo del proyecto se enfoca a la revisión de los géneros Sticta (Schreb.) Vain. y Pseudocyphellaria Vain., macrolíquenes foliosos pertenecientes a la familia Lobariaceae. Este proyecto se realiza desde una perspectiva morfológica y clásica  combinada con filogenética molecular que nos ayudará a conocer como se relacionan las especies entre si y los caracteres que podemos utilizar para su circunscripción.

A futuro:

Herramientas moleculares para la identificación de especies, filogénia de grupos de plantas de interés, estudios genético – espaciales de poblaciones que permitan establecer estrategias de conservación para los especímenes amenazados.

INTEGRANTES:

Blga.  Lorena Riofrío Guamán  –  E-mail: mlriofrio@utpl.edu.ec
Bq. Gabriela Cevallos Solórzano – E-mail: gcevallos@utpl.edu.ec

INTEGRANTES:

Blgo. Rodrigo Cisneros Vidal  –  E-mail: rcisneros@utpl.edu.ec

4. BIOTECNOLOGIA MICROBIANA

La línea se concibe como un equipo de profesionales orientado a organizar y dirigir los recursos minerales, con la finalidad de generar nuevos conocimientos e ideas en el campo de la Biotecnología Microbiana, las cuales tiene como función principal el desarrollo de tecnologías de procesamiento con vista al aprovechamiento de yacimientos de minerales y al manejo responsable de sus desechos.

MISION:

Generar conocimiento científico sobre el uso, manejo responsable y conservación de los recursos minerales, en beneficio de las comunidades humanas que dependen de ellos.

VISIÓN:

Ser un equipo de excelencia en investigación en biotecnología que provea conocimientos, servicios y procesos de vanguardia los cuales sirvan como eje fundamental para la toma de decisiones en el manejo sustentable de los recursos minerales.

Objetivos:

• Identificar y caracterizar la biodiversidad de los microorganismos potencialmente asociados a procesos productivos.
• Evaluar las características biológicas de los microorganismos identificados.
• Establecer los parámetros de optimización y escalamiento para el uso y aplicabilidad de los microorganismos de interés.
• Analizar cual es la diversidad de genes de interés en los microorganismos. Expresión de genes involucrados, selección de genes.
• Identificar, caracterizar  y clonar  proteínas de interés.

BIOMINERIA

Proyectos en ejecución:

“LIXIVIACIÓN DE SULFUROS METÁLICOS  MEDIANTE EL USO DE CONSORCIOS  BACTERIANOS NATIVOS”

Resumen: El objetivo de este trabajo fue determinar los valores óptimos de tamaño de partícula y concentración de pulpa con el fin de potenciar la cinética de biolixiviación de un concentrado de relaves de oro de dos sectores del sur del Ecuador (Portovelo y Bella Rica) utilizando microorganismos acidofilos nativos.

“DIVERSIDAD DE MICROORGANISMOS ACIDÓFILOS NATIVOS EN DRENAJES ÁCIDOS DE DOS DISTRITOS MINEROS DEL SUR DEL ECUADOR”

Resumen: El objetivo de este trabajo fue determinar la diversidad y la composición de comunidades microbianas (bacterias acidófilas) asociadas a estos dos drenajes ácidos correspondientes a los sectores mineros de Portovelo (P) y Bella Rica (BR) mediante técnicas independientes de cultivo: amplificación de un segmento del 16S rDNA, cloning y secuenciación.

“EL PAPEL MEDIOAMBIENTAL DE LA LIXIVIACIÓN BACTERIANA EN LA PEQUEÑA Y MEDIANA MINERÍA“

Resumen: El objetivo central de este proyecto es reunir a distintas Universidades de España e Iberoamérica, con experiencia dilatada en el campo de la Biohidrometalurgia, para estudiar un proceso de extracción de oro, eficiente y medioambientalmente limpio, a partir de materiales refractarios con difícil tratamiento, utilizando medios biológicos naturales y, por tanto, muy fáciles de incorporar a las instalaciones mineras artesanales que actualmente se siguen explotando en distintos países de Sudamérica.

A futuro:

Diversidad Molecular y Aislamiento de Arqueas asociadas a agua de drenaje ácidos de mina y relavera.

INTEGRANTES:
Ing. Paulina Aguirre  –  E-mail: piaguirre@utpl.edu.ec

Mgs.Alberto Aguirre – E-mail: aaaguirre1@utpl.edu.ec